Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARL1P40616 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL1P40616 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARL1P40616 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms