Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FLT4P35916 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FLT4P35916 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT4P35916 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT4P35916 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT4P35916 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT4P35916 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT4P35916 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FLT4P35916 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FLT4P35916 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT4P35916 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT4P35916 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT4P35916 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT4P35916 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT4P35916 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FLT4P35916 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms