Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms