Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBL1P28749 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBL1P28749 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBL1P28749 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBL1P28749 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms