Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNB1P11230 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms