Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM225BP0DP42 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms