Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPBP07199 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPBP07199 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms