Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFMP07197 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFMP07197 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFMP07197 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFMP07197 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms