Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOA1P02647 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOA1P02647 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms