Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGA10O75578 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms