Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms