Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms