Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNQ9UQP3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms