Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms