Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD1Q9UIS9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms