Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CGGBP1Q9UFW8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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