Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms