Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
BICRAQ9NZM4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BICRAQ9NZM4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms