Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms