Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK13-1Q9NX77 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms