Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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