Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC31BQ9NQW1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC31BQ9NQW1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms