Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms