Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNG6Q9BXT2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms