Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSBP4Q9BWG4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SSBP4Q9BWG4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms