Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms