Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HGDQ93099 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HGDQ93099 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HGDQ93099 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms