Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms