Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGP1Q92546 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms