Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFAP47Q6ZTR5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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