Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCSAPQ6IQ19 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCSAPQ6IQ19 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms