Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XAF1Q6GPH4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XAF1Q6GPH4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms