Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms