Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDK2Q58EX2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms