Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYTL3Q4VX76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms