Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBPF1Q3BBV0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBPF1Q3BBV0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms