Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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