Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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