Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SKAP2-202ENST00000432747 577 ntTSL 46.16□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 ARHGEF10L-207ENST00000482359 604 ntTSL 515.17■□□□□ 0.028e-7■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.167e-22■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 HLA-B-254ENST00000497377 917 nt10.88□□□□□ -0.677e-22■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 HLA-B-258ENST00000640615 240 ntBASIC8.51□□□□□ -1.057e-22■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 HLA-B-253ENST00000481849 753 nt8.24□□□□□ -1.097e-22■■■■□ 24.6
PCBP2Q15366 MAGI2-216ENST00000628997 641 ntTSL 312.64□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.029e-9■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-9■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.389e-9■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.389e-9■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.389e-9■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.539e-9■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 KCNAB3-203ENST00000570852 1315 ntTSL 518.23■□□□□ 0.514e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.377e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-207ENST00000478556 539 ntTSL 310.82□□□□□ -0.687e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.097e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PPP3CA-206ENST00000510292 581 ntTSL 37.79□□□□□ -1.164e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PPP3CA-204ENST00000492351 836 ntTSL 57.72□□□□□ -1.174e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.247e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.487e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.557e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.647e-11■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PHF1-209ENST00000487667 1930 ntTSL 520.07■□□□□ 0.82e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.81e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.931e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.421e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.441e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.571e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.871e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 IBTK-207ENST00000505222 5547 ntTSL 1 (best)2.9□□□□□ -1.941e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.852e-29■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.337e-8■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 CHCHD3-205ENST00000481152 1367 ntTSL 25.64□□□□□ -1.519e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 517.96■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC4-APOC2-201ENST00000585685 1829 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.671e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.31e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.491e-323■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TRIO-204ENST00000502816 736 ntTSL 223.28■■□□□ 1.329e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TRIO-207ENST00000505971 605 ntTSL 318.76■□□□□ 0.599e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZC3H11A-205ENST00000432282 682 ntTSL 58.78□□□□□ -14e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZC3H11A-208ENST00000466470 944 ntTSL 28.78□□□□□ -14e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZC3H11A-211ENST00000492823 447 ntTSL 38.39□□□□□ -1.074e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 ZC3H11A-207ENST00000461980 822 ntTSL 27.73□□□□□ -1.174e-7■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)24.84■■□□□ 1.572e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 217.9■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 24.5
PCBP2Q15366 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 310.61□□□□□ -0.712e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 57.05□□□□□ -1.282e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-224ENST00000624247 1263 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-219ENST00000493335 2937 ntTSL 214.37□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-213ENST00000460658 5080 ntTSL 513.52□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SMTN-218ENST00000489337 3560 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 TRIP12-215ENST00000479037 2938 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 TRIP12-209ENST00000435716 603 ntTSL 38.4□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.298e-10■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.138e-10■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.158e-10■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.165e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.295e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.884e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 218.28■□□□□ 0.524e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 PTP4A2-214ENST00000532289 610 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 317.98■□□□□ 0.471e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.444e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.394e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 217.11■□□□□ 0.333e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-7■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 516.82■□□□□ 0.284e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 416.5■□□□□ 0.234e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 216.31■□□□□ 0.24e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.9■□□□□ 0.144e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 414.53□□□□□ -0.084e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.08□□□□□ -0.164e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.69□□□□□ -0.224e-8■■■■□ 24.4
PCBP2Q15366 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 213.28□□□□□ -0.284e-8■■■■□ 24.4
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