Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A1Q14973 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms