Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF9Q13886 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF9Q13886 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF9Q13886 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF9Q13886 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLF9Q13886 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLF9Q13886 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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