Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNASE1L3Q13609 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms