Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF6Q13247 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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