Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRKAA1Q13131 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKAA1Q13131 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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