Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP53BP1Q12888 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms