Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms