Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD51Q06609 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD51Q06609 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms