Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN11Q06124 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms