Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OTUD4Q01804 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms