Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FANCCQ00597 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms